Postdoktor inom strukturbioinformatik

Publiceringsdatum: 2024-09-05

Är du intresserad av att jobba inom naturvetenskap? Letar du efter en chans att arbeta som bioinformatiker på Linköpings Universitet? Nu är det möjligt. Linköpings Universitet behöver någon som vill arbeta heltid. Om du är tillgänglig för 6 månader eller längre, ta en titt på denna jobbannons.

Linköping är platsen där detta jobb har sin tjänsteort. Linköpings Universitet söker för närvarande efter en person att anställa inom bioinformatiker-branschen. Ta en titt på deras lediga tjänst för att se om något av dem passar just dig. Bli en del av teamet hos Linköpings Universitet som bioinformatiker genom att ansöka senast måndag den trettionde september 2024.

Jobbannons

Vi har kraften från över 40 000 studenter och medarbetare. Studenter som ger framtidshopp. Medarbetare som varje dag bidrar till att Linköpings universitet tar sig an samtidens utmaningar. Vår värdegrund vilar på trovärdighet, tillit och trygghet. Genom att vara modiga, tänka fritt och göra nytt skapar vi tillsammans, med stora och små handlingar, en bättre framtid. Välkommen att söka jobb hos oss!

Dina arbetsuppgifter

I den här tjänsten kommer du att utveckla ett nytt ramverk för kryo-EM-analys i samarbete med ett annat labb, med hjälp av python och kompilerade språk för maskininlärning med högpresterande programkod som riktar sig mot nationell superdatorinfrastruktur. Du kommer också att utveckla metoder för att integrera verktyg för kryo-EM-analys i detta ramverk, lägga till ny funktionalitet och undersöka deras användning i studien av makromolekylärbiologi. Det finns också möjligheter till nationellt och internationellt samarbete inom både mjukvaruutveckling och tillämpad biologisk forskning.  

Som postdoktor kommer du i huvudsak bedriva forskning. Även undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock till högst en femtedel av arbetstiden. 

Dina kvalifikationer

För att vara behörig till anställning som postdoktor  har du avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Din examen ska vara avlagd senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

Det är meriterande om din examen är avlagd högst tre år före sista ansökningsdag för denna anställning. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare, exempelvis vid olika typer av lagstadgade ledigheter.

Vi söker dig som har erfarenhet av att producera högpresterande dataintensiv programvara i en samarbete med andra. Du förväntas vara påhittig och innovativ när det gäller att utveckla och optimera programvarans prestanda, prioritera robusthet och korrekthet i resultaten, kontinuerligt utveckla en kvalitetssäkringspipeline genom kontinuerlig integration och testning, samt att granska ditt eget arbete såväl som andras. Som postdoktor förväntas du också vara mentor för doktorander och aktivt delta i pågående forskningssamarbeten. Du kommer att tilldelas tid och resurser för att utveckla dina egna karriärmål och uppmuntras att utveckla dina egna idéer och samarbeten som relaterar till eller bygger vidare på din forskning i gruppen.

Erfarenhet av strukturbiologi eller bioinformatik är inte ett krav. Du kommer att få tid att bekanta dig med detta i praktiken.

Din arbetsplats

Strukturell bioinformatik betraktar molekylär struktur genom data, vilket omfattar maskininlärningsverktyg som AlphaFold, informationen i storskaliga databaser över DNA-sekvenser och genetisk evolution, samt mining av mikroskopidata genom bildanalys. Forskargruppen som leds av Björn Forsberg vid Linköpings universitet fokuserar sina ansträngningar på elektronmikroskopidata (cryo-EM och cryo-ET), som rekonstruerar 3D-modeller av protein, DNA och andra biomolekyler. Specifikt utvecklas och implementeras nästa generations verktyg för rigorösa och systematiska metoder för att kvantifiera heterogenitet i 3D-kryo-EM-rekonstruktioner. Detta ämnesområde innebär att vi använder en mängd olika metoder för statistik, datavetenskap och maskininlärning. Vi arbetar med samarbetspartners över hela världen för att tillämpa våra metoder på innovativa forskningsprojekt och experimentella data och tror på att utveckla allmänt tillämpliga öppna verktyg och paket som kan användas av det bredare vetenskapliga samfundet.

Teamet är baserat på avdelningen för bioinformatik vid Institutionen för fysik, kemi och biologi (IFM) vid Linköpings universitet, och har stöd av programmet för datadriven life science (DDLS) genom Science for Life Laboratory (SciLifeLab). DDLA är ett 12-årigt initiativ finansierat med totalt 3,1 miljarder kronor (~300 miljoner euro) från Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse för att rekrytera och utbilda nästa generations datadrivna biovetare och för att skapa globalt ledande beräknings- och datavetenskapsförmågor inom biovetenskap i Sverige. Programmet är ett nav för tvärvetenskaplig biovetenskap, tvärvetenskapligt arbete och engagemang med industri, hälso- och sjukvård och andra nationella och internationella partners. Teamet stöder och utnyttjar också den nationella anläggningen för kryo-EM-mikroskopi vid SciLifeLab Solna och Umeå, och använder den modernaste superdatorinfrastrukturen i Sverige (Berzelius@NSC). Nära samarbeten finns inom institutionen med Nicholas Pearce för makromolekylär variabilitetsanalys, och Björn Wallner och Claudio Mirabello för struktur- och ensembleprediktionsmetoder. Internationella samarbeten sträcker sig till bl.a. Chan-Zuckerberg Imaging Institute i San Francisco och University of Oxford.  

Om anställningen

Anställningen är en tidsbegränsad anställning på två år med möjlighet till förlängning med en sammanlagd anställningstid på högst tre år. Anställningen som postdoktor är på heltid.

Tillträde enligt överenskommelse. 

Lön och förmåner

Universitetet tillämpar individuell lönesättning, lämna löneanspråk i din ansökan.

Läs mer om förmåner för anställda här.

Fackliga kontaktpersoner

Information om fackliga kontaktpersoner, se Hjälp för sökande.

Ansökan

Du söker denna anställning genom att klicka på knappen ”Ansök” nedan. Din ansökan ska vara Linköpings universitet tillhanda senast den 30 september, 2024. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag beaktas ej.

Vi välkomnar sökande med olika bakgrund, erfarenheter och perspektiv, det berikar och utvecklar vår verksamhet. För oss är det självklart att värna om allas lika värde, rättigheter och möjligheter. Läs om vårt arbete med Lika villkor.

Välkommen med din ansökan!

Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.